Yhteistyötahot Rovaniemen lintuatlas -projekti on Lapin elinkeino-, liikenne- ja ympäristökeskuksen myöntämällä Euroopan aluekehitysrahaston tuella toteutettava, kaikkiaan 230 000 euron hanke, josta EAKR -rahoituksen osuus on 70 %. Lapin yliopiston rahoitusosuus kattaa 20 % projektin kustannuksista. Rovaniemen kaupunki osallistuu projektin kustannuksiin 10 prosentin rahoitusosuudellaan. Projektin hallinnoinnista ja koordinoinnista vastaa Lapin yliopiston Arktinen keskus, Luontoselvitys- ja YVA -palvelut. Muita Rovaniemen lintuatlas -projektin yhteistyötahoja ovat: